下記症状でしたが、他でポートが使われていたままのようでした。
ポートを変えてPCを再起動すると正常に動作しました。
ご迷惑をおかけして申し訳ありません。
ご対応ありがとうございました。

[Read]などのボタンの押下後すぐに「指定のCOMポートからの応答がありません。

comポート番号が正しく指定されている前提として、
ありがちなのは、ターミナルが開いているのがあります。この場合はターミナルを終了するだけです。

COMポート番号が違っていたり、COMポートが既にほかで使われていて、PicoRomWriterがCOMポートを開くのに失敗する場合は、[Read]などのボタンの押下後すぐに「指定のCOMポートからの応答がありません。デバイスが正しくつながっていますか？」というメッセージが表示されます。

COMポートのOpen後に失敗する場合、押下後１秒弱くらい待ってからエラーメッセージが表示されます。
後者の場合は、原因は今のところ思い当たりません。

なお、Arduino uno R3は、独自の回路でAquesTalk pico LSIのリセットを行いますので、ハードはいじらなくてOKです。

失礼しました。

症状ですが、ポート番号の指定は間違っていないのですが、「Read」をしても「指定のCOMポートからの応答がありません。デバイスが正しくつながっていますか？」
というメッセージが表示されます。
ATP3012F5-PUとATP3011F4-PUの両方で確認しています。

「認識しない」っていうのは、
具体的にはどういう症状なのでしょうか？

私も同じ症状に苦しんでします。
使っているのは、Arduino uno R3で、同じようにターミナルソフトは問題ないものの、PicoRomWriterで認識してくれません・・・。
ためしに、USB通信をしているICのDTRとRESET間に0.1uFをいれてもダメです（泣